使用生物顯微鏡的注意事項有以下幾點：

• 要養(yǎng)成兩眼同時睜開觀察的習慣，以左眼觀察視野，右眼用以繪圖；
  
• 水滴、酒精或其它藥品切勿頭和鏡臺，如果沾污應立即用擦鏡紙擦凈；
  
• 輕拿輕放，不可把顯微鏡放置在實驗臺的邊緣，應放在距邊緣10cm處，以免碰翻落地；
  
• 放置玻片標本時要對準通光孔，且不能反放玻片，防止壓壞玻片或碰壞物鏡；
  
• 保持顯微鏡的清潔，光學和照明部分只能用擦鏡紙擦拭，切忌口吹手抹或用布擦，機械部分用布擦拭；
  
• 持鏡時必須是右手握臂、左手托座的姿勢，不可單手提取，以免零件脫落或碰撞到其它地方；
  
• 不要隨意取下目鏡，以防止塵土落入物鏡，也不要任意拆卸各種零件，以防損壞。

使用完畢后，必須復原才能放回鏡箱內，其步驟是：

1. 取下標本片，轉動旋轉器使鏡頭離開通光孔；
2. 下降鏡臺，平放反光鏡；
3. 下降集光器（但不要接觸反光鏡）；
4. 關閉光圈，推片器回位；
5. 蓋上綢布和外罩，放回實驗臺柜內；
6. 最后填寫使用登記表。

注：反光鏡通常應垂直放，但有時因集光器沒提至應有高度，鏡臺下降時會碰壞光圈，所以這里改為平放。